In this work, we propose to address the detection of negation and speculation, and of their scope, in French biomedical documents. It has been indeed observed that they play an important role and provide crucial clues for other NLP applications. Our methods are based on CRFs and BiLSTM. We reach up to 97.21 % and 91.30 % F-measure for the detection of negation and speculation cues, respectively, using CRFs. For the computing of scope, we reach up to 90.81 % and 86.73 % F-measure on negation and speculation, respectively, using BiLSTM-CRF fed with word embeddings.

La détection automatique de la négation fait souvent partie des pré-requis dans les systèmes d’extraction d’information, notamment dans le domaine biomédical. Cet article présente nos contributions concernant la détection de la portée de la négation en français et portugais brésilien. Nous présentons d’une part deux corpus principalement constitués d’extraits de protocoles d’essais cliniques en français et portugais brésilien, dédiés aux critères d’inclusion de patients. Les marqueurs de négation et leurs portées y ont été annotés manuellement. Nous présentons d’autre part une approche par réseau de neurones récurrents pour extraire les portées.

Textual corpora are extremely important for various NLP applications as they provide information necessary for creating, setting and testing these applications and the corresponding tools. They are also crucial for designing reliable methods and reproducible results. Yet, in some areas, such as the medical area, due to confidentiality or to ethical reasons, it is complicated and even impossible to access textual data representative of those produced in these areas. We propose the CAS corpus built with clinical cases, such as they are reported in the published scientific literature in French. We describe this corpus, currently containing over 397,000 word occurrences, and the existing linguistic and semantic annotations.

L’un des objectifs de nos travaux, à terme, est de transformer un corpus de documents médicaux en données structurées pour en faciliter l’exploitation. Ainsi, il est nécessaire non seulement de détecter les concepts médicaux évoqués, mais aussi d’intégrer un processus capable d’identifier le contexte dans lequel est évoqué chaque concept médical. Dans cet article, nous revenons principalement sur les systèmes par apprentissage supervisé qui ont été proposé pour la détection de l’incertitude et de la négation. Ces dix dernières années, les travaux pour détecter l’incertitude et la négation dans les textes en anglais ont donné des résultats satisfaisants. Cependant, il existe encore une marge de progression non-négligeable.