La détection et diagnostic d’erreurs de prononciation nécessite des systèmes adaptés aux spécificités de la parole non-native. Élaborer de tels systèmes reste difficile à cause de la rareté des corpus dédiés incluant des annotations expertes. Dans cet article, nous proposons et comparons deux approches, l’une basée sur une transcription phonétique et l’autre sur l’alignement de signaux audio, élaborées dans le but de servir dans un programme d’entraînement à la prononciation assisté par ordinateur (EPAO). Nous les évaluons sur un corpus de parole non-native annoté selon des considérations didactiques, et nous trouvons que l’approche basée sur l’alignement a des propriétés préférables pour l’EPAO, dépassant la précision de l’autre approche de 31,1% et 3,8% en absolu sur deux erreurs communes des apprenants japonais du français.