באתר חמת גדר חמישה מעיינות, ארבעה שמהם נובעים מים מינרליים, עשירים בגופרית, ואחד של מים מתוקים: המים בחמת גדר ניחנים בשלוש תכונות חשובות: חום, עושר במינרלים ורדיואקטיביות.
מקור השם "חמת גדר" הוא בעיר ההלניסטית גדר, הממוקמת כיום בירדן, במרחק של כארבעה קילומטרים מחמת גדר.
לפי הסכמי שביתת הנשק משנת 1949 נקבע כי חמת גדר תיכלל ב"אזור המפורז הדרומי" – מנוקייב (צפונית לעין גב) עד מעגן, כולל בקעת חמת גדר, אז אל-חמה.
למרות שאזור חמת גדר נכלל בשטח המנדט הבריטי על ארץ ישראל, השתלטו עליו הסורים לאחר המלחמה.
בית המשפט קיבל את עמדת הנהלת אתר חמת גדר, והאתר נותר פתוח לציבור .
בגמרא אין תמימות דעים לגבי זהותה של חמת המקראית: "נחלקו ר' יוחנן ורבא, ר' יוחנן אמר: חמת זו טבריה ורבא אמר חמת זו חמת גדר"‏ חמת גדר הייתה פרוור של העיר ההלניסטית גדר.
ב-18 באפריל 2006 שוב הוציאה רופאת המחוז צו הפסקה מנהלי, שהורה לחברת "חמת גדר בע"מ" להפסיק כל פעילות במרחצאות.
