Virgile Barthet
2026
Is Clinical Text Enough? A Multimodal Study on Mortality Prediction in Heart Failure Patients
Oumaima El Khettari | Virgile Barthet | Guillaume Hocquet | Joconde Weller | Emmanuel Morin | Pierre Zweigenbaum
Proceedings of the Fifteenth Language Resources and Evaluation Conference
Oumaima El Khettari | Virgile Barthet | Guillaume Hocquet | Joconde Weller | Emmanuel Morin | Pierre Zweigenbaum
Proceedings of the Fifteenth Language Resources and Evaluation Conference
Accurate short-term mortality prediction in heart failure (HF) remains challenging, particularly when relying on structured electronic health record (EHR) data alone. We evaluate transformer-based models on a French HF cohort, comparing text-only, structured-only, multimodal, and LLM-based approaches. Our results show that enriching clinical text with entity-level representations improves prediction over CLS embeddings alone, and that supervised multimodal fusion of text and structured variables achieves the best overall performance. In contrast, large language models perform inconsistently across modalities and decoding strategies, with text-only prompts outperforming structured or multimodal inputs. These findings highlight that entity-aware multimodal transformers offer the most reliable solution for short-term HF outcome prediction, while current LLM prompting remains limited for clinical decision support.
2023
La pré-annotation automatique de textes cliniques comme support au dialogue avec les experts du domaine lors de la mise au point d’un schéma d’annotation
Virgile Barthet | Marie-José Aroulanda | Laura Monceaux-Cachard | Christine Jacquin | Cyril Grouin | Johann Gutton | Guillaume Hocquet | Pascal De Groote | Michel Komajda | Emmanuel Morin | Pierre Zweigenbaum
Actes de CORIA-TALN 2023. Actes de l'atelier "Analyse et Recherche de Textes Scientifiques" (ARTS)@TALN 2023
Virgile Barthet | Marie-José Aroulanda | Laura Monceaux-Cachard | Christine Jacquin | Cyril Grouin | Johann Gutton | Guillaume Hocquet | Pascal De Groote | Michel Komajda | Emmanuel Morin | Pierre Zweigenbaum
Actes de CORIA-TALN 2023. Actes de l'atelier "Analyse et Recherche de Textes Scientifiques" (ARTS)@TALN 2023
La pré-annotation automatique de textes est une tâche essentielle qui peut faciliter l’annotationd’un corpus de textes. Dans le contexte de la cardiologie, l’annotation est une tâche complexe quinécessite des connaissances approfondies dans le domaine et une expérience pratique dans le métier.Pré-annoter les textes vise à diminuer le temps de sollicitation des experts, facilitant leur concentrationsur les aspects plus critiques de l’annotation. Nous rapportons ici une expérience de pré-annotationde textes cliniques en cardiologie : nous présentons ses modalités et les observations que nous enretirons sur l’interaction avec les experts du domaine et la mise au point du schéma d’an