DOING@DEFT : cascade de CRF pour l’annotation d’entités cliniques imbriquées (DOING@DEFT : cascade of CRF for the annotation of nested clinical entities)
Anne-Lyse Minard, Andréane Roques, Nicolas Hiot, Mirian Halfeld Ferrari Alves, Agata Savary
Abstract
Cet article présente le système développé par l’équipe DOING pour la campagne d’évaluation DEFT 2020 portant sur la similarité sémantique et l’extraction d’information fine. L’équipe a participé uniquement à la tâche 3 : “extraction d’information”. Nous avons utilisé une cascade de CRF pour annoter les différentes informations à repérer. Nous nous sommes concentrés sur la question de l’imbrication des entités et de la pertinence d’un type d’entité pour apprendre à reconnaître un autre. Nous avons également testé l’utilisation d’une ressource externe, MedDRA, pour améliorer les performances du système et d’un pipeline plus complexe mais ne gérant pas l’imbrication des entités. Nous avons soumis 3 runs et nous obtenons en moyenne sur toutes les classes des F-mesures de 0,64, 0,65 et 0,61.- Anthology ID:
- 2020.jeptalnrecital-deft.7
- Volume:
- Actes de la 6e conférence conjointe Journées d'Études sur la Parole (JEP, 33e édition), Traitement Automatique des Langues Naturelles (TALN, 27e édition), Rencontre des Étudiants Chercheurs en Informatique pour le Traitement Automatique des Langues (RÉCITAL, 22e édition). Atelier DÉfi Fouille de Textes
- Month:
- 6
- Year:
- 2020
- Address:
- Nancy, France
- Editors:
- Rémi Cardon, Natalia Grabar, Cyril Grouin, Thierry Hamon
- Venue:
- JEP/TALN/RECITAL
- SIG:
- Publisher:
- ATALA et AFCP
- Note:
- Pages:
- 66–78
- Language:
- French
- URL:
- https://aclanthology.org/2020.jeptalnrecital-deft.7
- DOI:
- Cite (ACL):
- Anne-Lyse Minard, Andréane Roques, Nicolas Hiot, Mirian Halfeld Ferrari Alves, and Agata Savary. 2020. DOING@DEFT : cascade de CRF pour l’annotation d’entités cliniques imbriquées (DOING@DEFT : cascade of CRF for the annotation of nested clinical entities). In Actes de la 6e conférence conjointe Journées d'Études sur la Parole (JEP, 33e édition), Traitement Automatique des Langues Naturelles (TALN, 27e édition), Rencontre des Étudiants Chercheurs en Informatique pour le Traitement Automatique des Langues (RÉCITAL, 22e édition). Atelier DÉfi Fouille de Textes, pages 66–78, Nancy, France. ATALA et AFCP.
- Cite (Informal):
- DOING@DEFT : cascade de CRF pour l’annotation d’entités cliniques imbriquées (DOING@DEFT : cascade of CRF for the annotation of nested clinical entities) (Minard et al., JEP/TALN/RECITAL 2020)
- PDF:
- https://preview.aclanthology.org/ingest-acl-2023-videos/2020.jeptalnrecital-deft.7.pdf