@inproceedings{el-khettari-etal-2023-annotation,
    title = "Annotation d{'}interactions h{\^o}te-microbiote dans des articles scientifiques par similarit{\'e} s{\'e}mantique avec une ontologie",
    author = "El Khettari, Oumaima  and
      Quiniou, Solen  and
      Chaffron, Samuel",
    editor = {Boudin, Florian  and
      Daille, B{\'e}atrice  and
      Dufour, Richard  and
      El, Oumaima  and
      Houbre, Ma{\"e}l  and
      Jourdan, L{\'e}ane  and
      Kooli, Nihel},
    booktitle = "Actes de CORIA-TALN 2023. Actes de l'atelier ``Analyse et Recherche de Textes Scientifiques'' (ARTS)@TALN 2023",
    month = "6",
    year = "2023",
    address = "Paris, France",
    publisher = "ATALA",
    url = "https://preview.aclanthology.org/fix-sig-urls/2023.jeptalnrecital-arts.4/",
    pages = "21--26",
    language = "fra",
    abstract = "Nous nous int{\'e}ressons {\`a} l{'}extraction de relations, dans des articles scientifiques, portant sur le microbiome humain. Afin de construire un corpus annot{\'e}, nous avons {\'e}valu{\'e} l{'}utilisation de l{'}ontologie OHMI pour d{\'e}tecter les relations pr{\'e}sentes dans les phrases des articles scientifiques, en calculant la similarit{\'e} s{\'e}mantique entre les relations d{\'e}finies dans l{'}ontologie et les phrases des articles. Le mod{\`e}le BERT et trois variantes biom{\'e}dicales sont utilis{\'e}s pour obtenir les repr{\'e}sentations des relations et des phrases. Ces mod{\`e}les sont compar{\'e}s sur un corpus construit {\`a} partir d{'}articles scientifiques complets issus de la plateforme ISTEX, dont une sous-partie a {\'e}t{\'e} annot{\'e}e manuellement."
}