هناك ثلاث مؤسسات هي المسئولة عن التخطيط والإشراف على بناء البنية التحتية: الشركة القابضة لمياه الشرب والصرف الصحي (HCWW) ولها 26 شركة تابعة هي المسئولة عن تشغيل وصيانة المياه والصرف الصحي.
تم فصل التخطيط عن البنية التحتية لإمدادات المياه والصرف الصحي بين منظمتين، وهماالمؤسسة العامة لمياه الشرب، الهيئة العامة للصرف والصرف الصحي.
في إطار برنامج المياهالمحسنة والصرف الصحي (IWSP)، وقد تم الإتفاق في عام 2009، بأن شركات المياه والصرف الصحي ستكون المسئولة عن تنفيذ الاستثمارات، وبالتالي بواسطة رحيل المنظمة الوطنية لمياه الشرب والصرف الصحي.
وقد دعمت الولايات المتحدة تطوير مصر في قطاع المياه والصرف الصحي منذ وقت مبكر من أعوام 1980.
ومع ذلك، فإن البنك الدولي في إطار مشروع الصرف الصحي المتكامل للبنية التحتية قد وافق في عام 2008 بتقديم 320 مليون دولار أمريكي على مرحلتين وذلك من خلال المنظمة الوطنية لمياه الشرب والصرف الصحي.
تعريفة المياه والصرف الصحي في مصر هي من بين أدنى المستويات في العالم.
وبقيت المنظمة الوطنية لمياه الشرب والصرف الصحي هي المسئولة عن الاستثمار، في حين أن الشركات التابعة لها هي فقط المسئولة عن التشغيل.
على المستوى المحلي، وبناءا على دراسة المياه والصرف الصحي في قريتين بدلتا النيل والتي أجريت في أواخر الثمانينات.
في عام 2012، أنشأت الحكومة في عهد محمد مرسي، وزارة المياه والصرف الصحي، التي كانت في السابق جزءا من وزارة الإسكان.
الممارسة الجيدة لمرافق المياه والصرف الصحي هو أن تكون أقل من 5 موظفين.
الشركة القابضة لمياه الشرب والصرف الصحي، التي تأسست بموجب مرسوم في عام 2004، هي المسئولة عن الاستدامة المالية والتقنية للمحافظة المرافق القائمة.
على سبيل المثال، في القاهرة، لقد شاركت شركة السويس والإسماعيلية الخاصة لفحص المياه وشبكات الصرف الصحي، والحد من التسرب وتركيب عدادات المياه.
